Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ccndbp1Q3TVC7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccndbp1Q3TVC7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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