Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms