Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9130409I23RikQ3TS87 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9130409I23RikQ3TS87 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms