Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ctdnep1Q3TP92 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Ctdnep1Q3TP92 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Ctdnep1Q3TP92 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Ctdnep1Q3TP92 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Ctdnep1Q3TP92 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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