Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrx1Q3TL44 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms