Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms