Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fam107bQ3TGF2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam107bQ3TGF2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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