Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl1Q2VPR5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms