Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sap25Q1EHW4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sap25Q1EHW4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sap25Q1EHW4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sap25Q1EHW4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sap25Q1EHW4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sap25Q1EHW4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms