Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam47cQ14BE7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms