Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms