Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms