Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pglyrp4Q0VB07 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms