Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spata18Q0P557 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spata18Q0P557 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spata18Q0P557 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spata18Q0P557 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spata18Q0P557 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Spata18Q0P557 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spata18Q0P557 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spata18Q0P557 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spata18Q0P557 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spata18Q0P557 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spata18Q0P557 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spata18Q0P557 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms