Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Neurl1bQ0MW30 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms