Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NeblQ0II04 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms