Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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