Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cass4Q08EC4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cass4Q08EC4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cass4Q08EC4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cass4Q08EC4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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