Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms