Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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