Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mex3cQ05A36 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms