Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms