Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nf1Q04690 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms