Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms