Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JupQ02257 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JupQ02257 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JupQ02257 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JupQ02257 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JupQ02257 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JupQ02257 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
JupQ02257 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JupQ02257 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JupQ02257 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JupQ02257 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JupQ02257 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms