Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms