Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mc1rQ01727 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms