Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms