Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms