Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2aQ01320 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms