Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HmgcrQ01237 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms