Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms