Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelpQ01102 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms