Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms