Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SeleQ00690 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms