Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga4Q00651 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms