Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd80Q00609 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms