Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms