Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VldlrP98156 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms