Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1bP97952 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1bP97952 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms