Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata5P97489 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms