Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms