Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RptnP97347 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RptnP97347 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RptnP97347 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RptnP97347 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms