Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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