Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim43bP86448 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim43bP86448 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms