Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arf1P84078 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Arf1P84078 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Arf1P84078 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Arf1P84078 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arf1P84078 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms