Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Irx2P81066 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Irx2P81066 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Irx2P81066 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx2P81066 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Irx2P81066 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Irx2P81066 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx2P81066 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Irx2P81066 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Irx2P81066 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms