Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctps1P70698 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctps1P70698 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctps1P70698 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctps1P70698 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctps1P70698 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctps1P70698 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctps1P70698 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctps1P70698 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctps1P70698 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctps1P70698 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctps1P70698 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctps1P70698 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms