Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf11P70378 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf11P70378 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms