Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms